帕海貝爾是德國巴洛克時代後期作曲家兼教堂管風琴師，當時他是相當激進的作曲家，在世所寫的管風琴和鍵盤音樂是他主要受到肯定的創作領域，在新教宗教音樂創作方面，他的地位也相當高，可惜他的作品多都未能獲得妥善保存，更有部份依然淹沒在德國各地圖書館內。

帕海貝爾從小就展露對於知識追求的興趣，尤其是音樂。他在聖羅倫茲（St. Lorenz）高等學校就讀同時，也追隨許溫默（Heinrich Schwemmer）和魏克（Wecker）兩人學習作曲和器樂演奏的技巧。1669年六月二十九日，帕海貝爾進入阿爾道夫學校（Altdorf），並在聖羅倫茲教堂內擔任管風琴師。一年後，帕海貝爾因為經濟狀況被迫輟學，終止了他的大學教育。然而在隔年春天他因為在學術知識上展露的天分，而被選入另一所學院接受學者訓練，而且因為他在音樂上別有專精，學校更特許他在校外另外跟從普倫次（Kaspar Prentz）學習作曲。在普倫次的影響下，帕海貝爾逐漸將自己原有的北德風格轉向意大利風格。

由於帕海貝爾本人所信奉的是當時德國的新興路德教派，所以他追隨老師普倫次在1673年前往維也納，成為聖史提芬教堂的管風琴師。在維也納這座天主教城市中，帕海貝爾接觸到南德和意大利等地的天主教作曲家所寫的宗教音樂，之後他進了艾森納赫（Eisenach）擔任宮廷管風琴師，這是艾薩克遜-艾森納赫公爵，即約翰．喬治王子的轄地。五年後因為王子的哥哥過世，宮廷守喪，樂師都被裁撤，帕海貝爾於是在1678年5月18日離開艾森納赫。這之後帕海貝爾來到艾爾福特（Erfurt）的普雷迪格教堂（Predigerkirche）。這個教堂對管風琴師的要求很嚴格，除了要伴奏新教派門徒演唱聖歌，並要提供聖歌的前奏曲，風琴師不能亂彈即興，但每年都要將彈奏管風琴的心得和盡展發揮在一場精緻的演奏會上，以顯示不是尸位素餐之徒。因此，帕海貝爾的管風琴技術得以發揮，並發表不少重要的管風琴作品，奠立了他巴洛克後期管風琴名家的聲望。

1681年，帕海貝爾二十八歲時娶芭芭拉蓋布勒（Barbara Gabler）為妻，兩年後芭芭拉難產過世。隔年他再娶茱笛絲卓默（Judith Drommer），這一次婚姻為他帶來七名子女。艾森納赫就是巴哈的故鄉，所以帕海貝爾與巴哈的父親也熟識，他還當了巴哈姐姐的教父，也負責教導巴哈的哥哥音樂。巴哈父親過世之後，教育巴哈音樂的責任乃落在這位長兄的身上，所以我們可以說帕海貝爾就是巴哈的師祖。

離開了艾爾特，帕海貝爾來到伍騰堡（Wurttemberg）宮廷，伍騰堡位於斯圖嘉特，這是瑪德蓮娜女爵的轄地（Duchess Magdalena Sibylla），這個地方給他很多專業上的自由度，可惜好景不常1692年秋，因為法國大軍入侵，他被迫返回出生地紐倫堡，最後輾轉到了戈塔（Gotha）。碰巧出生地紐倫堡的聖塞巴德（St. Sebald）教堂的原任風琴師，也就是帕海貝爾的老師魏克過世，讓他得以順利接任老師之職位。他就在這裡一直待到他過世。在紐倫堡的五年間，巴海貝爾寫下了感恩讚歌（Magnificat）等重要的宗教合唱曲和管風琴賦格，被視為他晚年的代表作。