當圓頂的最初設計完成之後，貝爾尼尼遇到了一個棘手的問題。要將巨大的圓頂穩固地支撐在屋頂上，必須進行地基挖掘。貝爾尼尼叫人在教堂的地面上挖出4個直徑3公尺、深4公尺多的大洞，以安放4根巨大的柱子。開挖不久，工匠們就在下面發現了古代的石棺，裡面不僅有基督教徒的，也有異教徒的，這個發現令當時的人感到慌恐。
 
然而不可思議的事情發生了。這幾個洞挖了沒幾天，梵蒂岡圖書館的管理員突然間死去了，而他是為這次發掘進行記錄的人。緊接著，又有一些與此事相關的人先後死去。後來，教皇的私人牧師竟然也隨著這場「猝死潮」而升天，教皇本人也病情加重起來。紅衣主教們慌張起來，他們命令立即停止挖掘工作。
 
不久之後，教皇的病就好了起來，而挖掘工作得以繼續進行，相關人士也沒有再傳出死亡的消息。然而彼得本人的墓葬並沒有在這次挖掘中被發現，這也是預料中的事，因為圓頂的基礎是插在它的四個角上的，所以貝爾尼尼和周圍的人們寧願相信在中央墓穴的下面，埋著的就是彼得本人。
 
1633年6月29日聖彼得節那天，圓頂建成揭幕。高達29公尺，人們遠遠地就能看到這座圓頂的存在。貝爾尼尼為巨大的圓頂設計了盤旋向上的青銅柱子，支撐住屋頂，使整個建築呈現出一種飛騰向上的趨勢。它完全可以和米開朗基羅為聖彼得大教堂設計的不可思議的大圓頂相媲美。柱頂上立有天使像，上面還安放了寶珠和十字架。烏班教皇的徽章圖案——蜜蜂、月桂樹葉和小太陽等分佈在圓頂的各處，清楚地表明這座圓頂是教皇烏班八世時代的創造。
 
聖彼得大教堂的穹頂從外面看起來非常壯觀雄偉，但如果到了教堂裡面，站在高大的穹頂底下舉目向上望去，它的高度未免讓人感覺可怕。貝爾尼尼在設計圓頂的時候考慮到了這一點，他把圓頂也造得相當高大，因穹頂過高造成的壓迫感就能得到有效的緩解。這是貝爾尼尼對米開朗基羅所做工作的一個巧妙修補。