而其召集五院院長會議，解決各院間爭端之規定，更使總統成為五院之重心。至其統率海陸空軍之權，不受法律之限制。且必要時可發佈緊急命令及執行緊急處分，雖有終年不閉會之立法院，亦無須其同意。在過渡時期又有任命半數立法委員及半數監察委員之權。政府大權可謂已盡集中，其集權趨勢，實超過現代任何行總統制之民主國家。」
 
3. 「五五憲草」的主要內容
 
五五憲草規定：人民得選舉、罷免縣治人員，創制、複決縣治事項。關於中央事務，則由人民選舉代表、組成國民大會，對於總統、副總統、立法院監察院兩院正副院長行使選舉權，對於上述人員及司法院考試院兩院正副院長行使罷免權；國民大會對於中央法律行使創制、複決兩權；修憲權則是國民大會的專有權力。國民大會權力很大，但是很少開會，會期也很短，每三年由總統召集一次，會期一個月，必要時得延長一個月；經五分之二以上國大代表同意，或總統召集，可召開臨時國民大會。
 
五五憲草在中央政府設置總統與五院，《孫文學說》並未明確規劃它們彼此間的關係，但根據其權能分治、萬能政府之說推論，五院之間應是合作重於制衡，而總統處於統攝地位。總統兼為國家元首和行政領袖，行政院長由總統任免，對總統負責；司法院考試院兩院正副院長由總統任命。在五權政府中沒有與總統相抗衡的力量，而作為政權機關的國民大會又很少開會、會期且短，這很容易造成總統專權，所以五五憲草確立的中央政制常被指是超級總統制。
 
關於中央與地方的權限關係，立法院憲法起草委員會起初主張： 「關於中央事權採列舉方式，關於地方事權採概括方式」。但是經過立法院與國民黨中央的審查後，地方自治的範圍越來越窄，重點有二：（1）省的自治地位被取消，省長由中央政府任命，省政府的職能為執行中央法令、監督地方自治；（2）縣作為唯一憲法上的地方自治單位，而地方自治事項則以法律定之，這意味着中央可以通過立法任意變更中央與地方事權的範圍，地方自治的憲法保障非常脆弱。